Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL3P36405 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL3P36405 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL3P36405 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL3P36405 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL3P36405 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL3P36405 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL3P36405 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL3P36405 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL3P36405 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL3P36405 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL3P36405 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL3P36405 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL3P36405 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL3P36405 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL3P36405 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL3P36405 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL3P36405 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL3P36405 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL3P36405 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL3P36405 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL3P36405 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL3P36405 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL3P36405 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL3P36405 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL3P36405 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL3P36405 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL3P36405 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL3P36405 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL3P36405 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL3P36405 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL3P36405 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL3P36405 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL3P36405 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL3P36405 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL3P36405 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL3P36405 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL3P36405 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL3P36405 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL3P36405 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL3P36405 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL3P36405 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL3P36405 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL3P36405 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL3P36405 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL3P36405 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL3P36405 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL3P36405 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL3P36405 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL3P36405 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL3P36405 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL3P36405 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL3P36405 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL3P36405 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL3P36405 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL3P36405 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL3P36405 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL3P36405 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL3P36405 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL3P36405 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL3P36405 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL3P36405 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL3P36405 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL3P36405 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL3P36405 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL3P36405 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL3P36405 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL3P36405 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL3P36405 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL3P36405 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL3P36405 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL3P36405 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL3P36405 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms