Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFC1P35251 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFC1P35251 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFC1P35251 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFC1P35251 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFC1P35251 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFC1P35251 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFC1P35251 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RFC1P35251 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFC1P35251 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RFC1P35251 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFC1P35251 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFC1P35251 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RFC1P35251 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFC1P35251 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFC1P35251 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFC1P35251 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFC1P35251 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFC1P35251 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFC1P35251 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFC1P35251 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFC1P35251 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFC1P35251 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFC1P35251 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFC1P35251 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFC1P35251 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFC1P35251 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFC1P35251 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFC1P35251 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFC1P35251 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RFC1P35251 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFC1P35251 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFC1P35251 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFC1P35251 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFC1P35251 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RFC1P35251 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFC1P35251 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFC1P35251 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFC1P35251 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFC1P35251 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFC1P35251 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFC1P35251 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFC1P35251 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFC1P35251 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFC1P35251 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFC1P35251 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFC1P35251 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFC1P35251 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFC1P35251 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFC1P35251 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFC1P35251 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFC1P35251 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFC1P35251 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFC1P35251 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFC1P35251 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFC1P35251 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFC1P35251 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFC1P35251 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFC1P35251 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFC1P35251 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFC1P35251 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFC1P35251 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFC1P35251 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFC1P35251 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFC1P35251 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFC1P35251 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFC1P35251 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFC1P35251 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFC1P35251 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFC1P35251 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFC1P35251 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFC1P35251 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFC1P35251 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFC1P35251 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFC1P35251 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RFC1P35251 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFC1P35251 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RFC1P35251 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RFC1P35251 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RFC1P35251 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RFC1P35251 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RFC1P35251 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFC1P35251 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFC1P35251 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFC1P35251 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFC1P35251 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RFC1P35251 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RFC1P35251 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFC1P35251 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFC1P35251 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RFC1P35251 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RFC1P35251 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFC1P35251 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RFC1P35251 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RFC1P35251 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RFC1P35251 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFC1P35251 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RFC1P35251 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFC1P35251 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFC1P35251 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms