Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms