Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
CLIP1P30622 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms