Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJB2P29033 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJB2P29033 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJB2P29033 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJB2P29033 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB2P29033 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB2P29033 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB2P29033 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB2P29033 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB2P29033 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB2P29033 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB2P29033 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB2P29033 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB2P29033 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB2P29033 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB2P29033 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB2P29033 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB2P29033 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB2P29033 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB2P29033 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB2P29033 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB2P29033 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB2P29033 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB2P29033 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB2P29033 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB2P29033 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB2P29033 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB2P29033 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB2P29033 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB2P29033 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB2P29033 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB2P29033 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB2P29033 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB2P29033 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB2P29033 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB2P29033 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB2P29033 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB2P29033 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB2P29033 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB2P29033 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB2P29033 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB2P29033 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB2P29033 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB2P29033 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB2P29033 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB2P29033 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB2P29033 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB2P29033 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB2P29033 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB2P29033 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB2P29033 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB2P29033 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB2P29033 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB2P29033 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB2P29033 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB2P29033 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB2P29033 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB2P29033 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB2P29033 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB2P29033 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms