Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms