Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
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