Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms