Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms