Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms