Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD44P16070 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD44P16070 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD44P16070 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD44P16070 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD44P16070 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD44P16070 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CD44P16070 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD44P16070 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD44P16070 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD44P16070 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD44P16070 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD44P16070 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD44P16070 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD44P16070 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD44P16070 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD44P16070 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD44P16070 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD44P16070 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD44P16070 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD44P16070 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD44P16070 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD44P16070 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD44P16070 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD44P16070 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD44P16070 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD44P16070 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD44P16070 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD44P16070 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CD44P16070 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD44P16070 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD44P16070 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD44P16070 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD44P16070 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD44P16070 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD44P16070 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD44P16070 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD44P16070 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD44P16070 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD44P16070 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD44P16070 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD44P16070 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD44P16070 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD44P16070 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD44P16070 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD44P16070 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD44P16070 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD44P16070 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD44P16070 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD44P16070 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD44P16070 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD44P16070 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms