Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC5A1P13866 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms