Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT13P13646 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT13P13646 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT13P13646 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT13P13646 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT13P13646 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT13P13646 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT13P13646 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT13P13646 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT13P13646 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT13P13646 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT13P13646 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT13P13646 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT13P13646 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT13P13646 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT13P13646 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT13P13646 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT13P13646 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT13P13646 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT13P13646 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT13P13646 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT13P13646 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT13P13646 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT13P13646 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT13P13646 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT13P13646 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT13P13646 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT13P13646 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT13P13646 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT13P13646 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT13P13646 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT13P13646 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT13P13646 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT13P13646 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT13P13646 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT13P13646 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT13P13646 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT13P13646 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT13P13646 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT13P13646 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT13P13646 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT13P13646 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT13P13646 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT13P13646 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT13P13646 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT13P13646 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT13P13646 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT13P13646 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT13P13646 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT13P13646 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT13P13646 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT13P13646 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT13P13646 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT13P13646 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT13P13646 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT13P13646 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT13P13646 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT13P13646 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT13P13646 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT13P13646 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT13P13646 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT13P13646 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT13P13646 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT13P13646 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT13P13646 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT13P13646 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT13P13646 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT13P13646 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT13P13646 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT13P13646 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT13P13646 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT13P13646 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT13P13646 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT13P13646 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT13P13646 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT13P13646 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT13P13646 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT13P13646 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT13P13646 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT13P13646 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT13P13646 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT13P13646 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT13P13646 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT13P13646 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT13P13646 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT13P13646 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT13P13646 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT13P13646 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT13P13646 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT13P13646 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT13P13646 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT13P13646 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT13P13646 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT13P13646 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT13P13646 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT13P13646 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT13P13646 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT13P13646 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT13P13646 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT13P13646 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms