Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT10P13645 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT10P13645 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT10P13645 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT10P13645 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT10P13645 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT10P13645 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT10P13645 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT10P13645 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT10P13645 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT10P13645 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT10P13645 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT10P13645 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT10P13645 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT10P13645 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT10P13645 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT10P13645 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT10P13645 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT10P13645 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT10P13645 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT10P13645 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT10P13645 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT10P13645 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT10P13645 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT10P13645 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT10P13645 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT10P13645 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT10P13645 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT10P13645 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT10P13645 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT10P13645 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT10P13645 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT10P13645 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT10P13645 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT10P13645 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT10P13645 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT10P13645 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT10P13645 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT10P13645 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT10P13645 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT10P13645 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT10P13645 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT10P13645 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT10P13645 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT10P13645 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT10P13645 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT10P13645 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT10P13645 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT10P13645 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT10P13645 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT10P13645 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT10P13645 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT10P13645 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT10P13645 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT10P13645 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT10P13645 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT10P13645 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT10P13645 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT10P13645 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT10P13645 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT10P13645 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT10P13645 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT10P13645 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT10P13645 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT10P13645 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT10P13645 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT10P13645 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT10P13645 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT10P13645 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT10P13645 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT10P13645 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT10P13645 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT10P13645 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT10P13645 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT10P13645 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT10P13645 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT10P13645 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT10P13645 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT10P13645 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT10P13645 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT10P13645 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT10P13645 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT10P13645 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT10P13645 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT10P13645 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT10P13645 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT10P13645 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT10P13645 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT10P13645 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT10P13645 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT10P13645 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT10P13645 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT10P13645 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT10P13645 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT10P13645 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT10P13645 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT10P13645 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT10P13645 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT10P13645 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT10P13645 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms