Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHGAP10645 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHGAP10645 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHGAP10645 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHGAP10645 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CHGAP10645 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHGAP10645 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CHGAP10645 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHGAP10645 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHGAP10645 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHGAP10645 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHGAP10645 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHGAP10645 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHGAP10645 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHGAP10645 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHGAP10645 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHGAP10645 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CHGAP10645 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CHGAP10645 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHGAP10645 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHGAP10645 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHGAP10645 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHGAP10645 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHGAP10645 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHGAP10645 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHGAP10645 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHGAP10645 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHGAP10645 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHGAP10645 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHGAP10645 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHGAP10645 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHGAP10645 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHGAP10645 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHGAP10645 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHGAP10645 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHGAP10645 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHGAP10645 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHGAP10645 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHGAP10645 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHGAP10645 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHGAP10645 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CHGAP10645 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHGAP10645 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHGAP10645 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHGAP10645 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHGAP10645 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHGAP10645 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHGAP10645 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHGAP10645 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHGAP10645 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHGAP10645 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CHGAP10645 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHGAP10645 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHGAP10645 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHGAP10645 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHGAP10645 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHGAP10645 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHGAP10645 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CHGAP10645 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHGAP10645 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHGAP10645 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHGAP10645 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHGAP10645 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHGAP10645 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHGAP10645 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHGAP10645 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHGAP10645 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CHGAP10645 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHGAP10645 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHGAP10645 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CHGAP10645 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CHGAP10645 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHGAP10645 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHGAP10645 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHGAP10645 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CHGAP10645 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHGAP10645 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHGAP10645 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHGAP10645 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHGAP10645 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHGAP10645 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHGAP10645 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHGAP10645 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHGAP10645 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHGAP10645 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHGAP10645 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHGAP10645 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHGAP10645 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHGAP10645 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHGAP10645 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHGAP10645 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHGAP10645 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHGAP10645 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHGAP10645 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHGAP10645 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHGAP10645 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHGAP10645 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHGAP10645 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHGAP10645 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHGAP10645 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms