Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM228BP0C875 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms