Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTNP04004 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTNP04004 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VTNP04004 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTNP04004 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTNP04004 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTNP04004 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTNP04004 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTNP04004 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTNP04004 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTNP04004 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTNP04004 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTNP04004 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTNP04004 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTNP04004 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTNP04004 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTNP04004 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTNP04004 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTNP04004 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTNP04004 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTNP04004 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTNP04004 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTNP04004 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTNP04004 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTNP04004 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VTNP04004 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VTNP04004 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTNP04004 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VTNP04004 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTNP04004 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTNP04004 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTNP04004 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTNP04004 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTNP04004 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTNP04004 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTNP04004 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTNP04004 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTNP04004 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTNP04004 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTNP04004 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTNP04004 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTNP04004 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTNP04004 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTNP04004 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTNP04004 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTNP04004 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTNP04004 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTNP04004 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTNP04004 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTNP04004 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VTNP04004 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTNP04004 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTNP04004 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTNP04004 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTNP04004 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTNP04004 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTNP04004 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTNP04004 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTNP04004 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTNP04004 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTNP04004 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTNP04004 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VTNP04004 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTNP04004 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTNP04004 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTNP04004 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTNP04004 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTNP04004 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTNP04004 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTNP04004 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTNP04004 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTNP04004 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTNP04004 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTNP04004 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTNP04004 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VTNP04004 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTNP04004 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTNP04004 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTNP04004 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTNP04004 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTNP04004 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTNP04004 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTNP04004 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTNP04004 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTNP04004 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTNP04004 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTNP04004 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTNP04004 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTNP04004 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTNP04004 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTNP04004 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTNP04004 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTNP04004 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTNP04004 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTNP04004 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTNP04004 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTNP04004 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTNP04004 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTNP04004 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms