Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms