Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX58O95786 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX58O95786 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX58O95786 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX58O95786 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX58O95786 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX58O95786 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX58O95786 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX58O95786 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX58O95786 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX58O95786 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX58O95786 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX58O95786 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX58O95786 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX58O95786 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX58O95786 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX58O95786 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX58O95786 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX58O95786 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX58O95786 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX58O95786 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX58O95786 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX58O95786 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX58O95786 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX58O95786 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX58O95786 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX58O95786 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX58O95786 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX58O95786 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX58O95786 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX58O95786 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX58O95786 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX58O95786 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX58O95786 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX58O95786 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX58O95786 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX58O95786 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX58O95786 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX58O95786 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX58O95786 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX58O95786 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDX58O95786 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDX58O95786 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
DDX58O95786 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX58O95786 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX58O95786 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX58O95786 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX58O95786 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX58O95786 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX58O95786 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX58O95786 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX58O95786 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX58O95786 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX58O95786 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX58O95786 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX58O95786 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX58O95786 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX58O95786 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX58O95786 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX58O95786 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX58O95786 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX58O95786 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX58O95786 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX58O95786 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX58O95786 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX58O95786 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX58O95786 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX58O95786 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX58O95786 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX58O95786 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX58O95786 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX58O95786 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX58O95786 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX58O95786 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX58O95786 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX58O95786 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX58O95786 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX58O95786 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX58O95786 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX58O95786 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX58O95786 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX58O95786 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX58O95786 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX58O95786 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX58O95786 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX58O95786 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX58O95786 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX58O95786 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX58O95786 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX58O95786 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX58O95786 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX58O95786 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX58O95786 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX58O95786 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX58O95786 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX58O95786 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX58O95786 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX58O95786 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX58O95786 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX58O95786 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms