Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms