Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms