Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms