Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms