Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEMFO60524 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEMFO60524 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEMFO60524 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEMFO60524 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEMFO60524 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEMFO60524 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEMFO60524 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEMFO60524 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEMFO60524 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEMFO60524 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEMFO60524 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEMFO60524 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEMFO60524 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEMFO60524 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMFO60524 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMFO60524 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMFO60524 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMFO60524 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMFO60524 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMFO60524 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMFO60524 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMFO60524 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMFO60524 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMFO60524 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMFO60524 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMFO60524 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMFO60524 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMFO60524 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMFO60524 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMFO60524 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMFO60524 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMFO60524 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMFO60524 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMFO60524 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMFO60524 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMFO60524 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMFO60524 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMFO60524 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMFO60524 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMFO60524 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMFO60524 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMFO60524 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMFO60524 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMFO60524 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMFO60524 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMFO60524 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMFO60524 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMFO60524 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMFO60524 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMFO60524 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMFO60524 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMFO60524 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMFO60524 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMFO60524 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMFO60524 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMFO60524 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMFO60524 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMFO60524 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMFO60524 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMFO60524 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMFO60524 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMFO60524 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMFO60524 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMFO60524 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMFO60524 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMFO60524 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMFO60524 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMFO60524 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMFO60524 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMFO60524 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMFO60524 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMFO60524 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMFO60524 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMFO60524 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMFO60524 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMFO60524 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMFO60524 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMFO60524 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMFO60524 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMFO60524 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMFO60524 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMFO60524 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMFO60524 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMFO60524 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMFO60524 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMFO60524 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMFO60524 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMFO60524 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMFO60524 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMFO60524 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMFO60524 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMFO60524 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMFO60524 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEMFO60524 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEMFO60524 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEMFO60524 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEMFO60524 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEMFO60524 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEMFO60524 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms