Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEFVO15553 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEFVO15553 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEFVO15553 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEFVO15553 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEFVO15553 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEFVO15553 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEFVO15553 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEFVO15553 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEFVO15553 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEFVO15553 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEFVO15553 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEFVO15553 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEFVO15553 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEFVO15553 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEFVO15553 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEFVO15553 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEFVO15553 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEFVO15553 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEFVO15553 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEFVO15553 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEFVO15553 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEFVO15553 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEFVO15553 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEFVO15553 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEFVO15553 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEFVO15553 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MEFVO15553 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEFVO15553 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEFVO15553 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEFVO15553 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEFVO15553 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEFVO15553 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEFVO15553 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEFVO15553 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEFVO15553 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MEFVO15553 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MEFVO15553 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEFVO15553 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEFVO15553 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEFVO15553 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEFVO15553 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEFVO15553 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEFVO15553 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEFVO15553 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEFVO15553 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEFVO15553 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEFVO15553 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEFVO15553 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MEFVO15553 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEFVO15553 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEFVO15553 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEFVO15553 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEFVO15553 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEFVO15553 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEFVO15553 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEFVO15553 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEFVO15553 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEFVO15553 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEFVO15553 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEFVO15553 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEFVO15553 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MEFVO15553 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEFVO15553 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEFVO15553 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEFVO15553 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEFVO15553 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEFVO15553 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEFVO15553 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEFVO15553 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEFVO15553 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MEFVO15553 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEFVO15553 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEFVO15553 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEFVO15553 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MEFVO15553 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEFVO15553 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEFVO15553 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEFVO15553 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEFVO15553 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEFVO15553 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEFVO15553 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEFVO15553 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEFVO15553 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEFVO15553 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEFVO15553 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEFVO15553 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MEFVO15553 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEFVO15553 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEFVO15553 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEFVO15553 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEFVO15553 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEFVO15553 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEFVO15553 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEFVO15553 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEFVO15553 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MEFVO15553 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEFVO15553 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEFVO15553 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEFVO15553 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms