Protein–RNA interactions for Protein: O15259

NPHP1, Nephrocystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP1O15259 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP1O15259 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP1O15259 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP1O15259 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP1O15259 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP1O15259 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP1O15259 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP1O15259 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP1O15259 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP1O15259 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP1O15259 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP1O15259 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms