Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP1O00294 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP1O00294 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP1O00294 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP1O00294 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP1O00294 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP1O00294 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP1O00294 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP1O00294 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP1O00294 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP1O00294 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP1O00294 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP1O00294 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP1O00294 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP1O00294 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP1O00294 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP1O00294 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP1O00294 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP1O00294 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP1O00294 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP1O00294 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP1O00294 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP1O00294 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP1O00294 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP1O00294 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP1O00294 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP1O00294 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP1O00294 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP1O00294 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP1O00294 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP1O00294 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP1O00294 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP1O00294 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP1O00294 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP1O00294 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP1O00294 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP1O00294 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP1O00294 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP1O00294 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP1O00294 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP1O00294 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP1O00294 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP1O00294 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP1O00294 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP1O00294 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP1O00294 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP1O00294 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP1O00294 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP1O00294 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP1O00294 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP1O00294 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP1O00294 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP1O00294 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP1O00294 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP1O00294 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP1O00294 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP1O00294 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP1O00294 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP1O00294 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP1O00294 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP1O00294 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP1O00294 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP1O00294 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP1O00294 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP1O00294 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP1O00294 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP1O00294 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP1O00294 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP1O00294 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP1O00294 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms