Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SUPT5HO00267 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SUPT5HO00267 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SUPT5HO00267 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SUPT5HO00267 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SUPT5HO00267 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SUPT5HO00267 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SUPT5HO00267 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SUPT5HO00267 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SUPT5HO00267 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
SUPT5HO00267 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
SUPT5HO00267 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
SUPT5HO00267 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SUPT5HO00267 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SUPT5HO00267 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SUPT5HO00267 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SUPT5HO00267 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SUPT5HO00267 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SUPT5HO00267 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SUPT5HO00267 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SUPT5HO00267 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
SUPT5HO00267 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SUPT5HO00267 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SUPT5HO00267 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SUPT5HO00267 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SUPT5HO00267 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SUPT5HO00267 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SUPT5HO00267 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SUPT5HO00267 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SUPT5HO00267 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SUPT5HO00267 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms