Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms