Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms