Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms