Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDR42E2A6NKP2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms