Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms