Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
U3KQE9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
U3KQE9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
U3KQE9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U3KQE9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U3KQE9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
U3KQE9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
U3KQE9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U3KQE9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
U3KQE9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
U3KQE9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U3KQE9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U3KQE9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
U3KQE9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQE9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQE9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQE9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQE9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQE9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQE9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQE9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQE9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQE9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQE9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms