Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SETBP1Q9Y6X0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms