Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms