Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms