Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CD2APQ9Y5K6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms