Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms