Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms