Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms