Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms