Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms