Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV9

PFDN2, Prefoldin subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN2Q9UHV9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN2Q9UHV9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms