Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms