Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms