Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms