Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms