Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ASF1BQ9NVP2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ASF1BQ9NVP2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ASF1BQ9NVP2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
ASF1BQ9NVP2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ASF1BQ9NVP2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ASF1BQ9NVP2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ASF1BQ9NVP2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms