Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms